Los métodos para el análisis de péptidos por LC-MS usan a menudo fases móviles acidificadas, que pueden cambiar retención y selectividad. Aquí, se demuestran los efectos de la modificación del tipo de ácido, la concentración de ácido, la temperatura y la pendiente del gradiente usando varias sondas de prueba.

Para este trabajo se utilizó la columna Raptor ARC-18 porque el ligando de la fase estacionaria está protegido estéricamente, haciéndolo extremadamente estable y resistente al daño ácido a pHs bajos, característica importante al desarrollar métodos LC-MS para análisis de péptidos.